Traitement d'images médicales
Master InformatiqueParcours Nouvelles technologies pour la santé (NTS)
Compétences requises
Traitement des signaux bidimensionnels.
Outils fondamentaux en vision par ordinateur.
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Two-dimensional signal processing.
Fundamental tools in computer vision.
Compétences visées
Ce cours a pour objectif de donner une vue d'ensemble des problématiques et spécificités liées à l’analyse et au traitement des images médicales et de mettre en pratique des méthodes de traitement appliquées à des images médicales via un langage de programmation scientifique et l’utilisation de logiciels dédiés.
À l’issue de cet enseignement, l’étudiant aura une vue d'ensemble de quelques outils de traitement d'images médicales récents et des problèmes rencontrés dans l'analyse de ces images. A l’aide des outils acquis, il sera en mesure de maîtriser une chaîne de traitement d'images médicales et de développer de nouveaux algorithmes.
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The objective of this lecture is to give an overview of the problematics and particularities related to the analysis and processing of medical images and to implement processing methods applied to medical images via a scientific programming language and the use of dedicated software.
At the end of this lecture, the student will have an overview of some recent medical image processing tools and of the various challenges encountered in the analysis of these images. Thanks to the acquired knowledge, the student will be able to manage medical image processing pipelines and to develop new algorithms.
Syllabus
- Rappel des modalités d’imagerie médicale
- Place de l’image dans le domaine médical
- Particularités de l’image médicale : multimodalité, dimensionnalité,...
- Visualisation : multiplanaire, MIP, 3D, …
- Format de fichier : dicom, nifti
- Recalage : mesures de similarité, modèles de transformation, déformation d’images, méthodes par apprentissage, applications
- Segmentation : notion d’a priori, segmentation multi-atlas, sur les relations spatiales, la topologie et la forme, applications
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- Reminder of medical imaging modalities
- The role of the image in the medical field
- Particularities of the medical image: multimodality, dimensionality,...
- Visualization: multiplanar, MIP, 3D, ...
- File format: dicom, nifti
- Registration: similarity measure, transformation models, image warping, learning-based methods, applications
- Segmentation: concept of a priori, multi-atlas segmentation, priors on spatial relations, topology and shape, applications
Informations complémentaires
Pour les étudiants du parcours Imagerie, robotique médicale et chirurgicale suivant cette matière dans le cadre du bloc 1 et 2 de l'UE 4 - IRMC "médecin", celle-ci est équivalente à 3 ECTS.